NER example doesn't work

nlp
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Hi,

I’m working through the text tokenization example here using the tensorflow version run_tf_ner.py (PyTorch version works):

Keep getting the error below. Tried with different datasets and still get this so I think there’s a problem with the example itself. I created a Colab for it here:

https://colab.research.google.com/drive/10GrYSYx5sUVMXplgUS79fIV73bFtoiHX?usp=sharing

How can I fix the example so it works?

05/31/2020 00:07:45 - INFO - utils_ner -   tokens: [CLS] dar ##aus en ##t ##wick ##elt ##e sic ##h im ro ##ko ##ko die sit ##te des gem ##ein ##sam ##en wei ##nen ##s im theater , das die stand ##es ##gren ##zen inner ##hal ##b des pub ##lik ##ums uber ##bruck ##en sol ##lt ##e . [SEP]
05/31/2020 00:07:45 - INFO - utils_ner -   input_ids: 101 18243 20559 4372 2102 7184 20042 2063 14387 2232 10047 20996 3683 3683 3280 4133 2618 4078 17070 12377 21559 2368 11417 10224 2015 10047 4258 1010 8695 3280 3233 2229 13565 10431 5110 8865 2497 4078 9047 18393 18163 19169 28985 2368 14017 7096 2063 1012 102 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
05/31/2020 00:07:45 - INFO - utils_ner -   input_mask: 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
05/31/2020 00:07:45 - INFO - utils_ner -   segment_ids: 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
05/31/2020 00:07:45 - INFO - utils_ner -   label_ids: -1 24 -1 24 -1 -1 -1 -1 24 -1 24 6 -1 -1 24 24 -1 24 24 -1 -1 -1 24 -1 -1 24 24 24 24 24 24 -1 -1 -1 24 -1 -1 24 24 -1 -1 24 -1 -1 24 -1 -1 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1
05/31/2020 00:07:54 - WARNING - transformers.training_args -   Using deprecated `--per_gpu_train_batch_size` argument which will be removed in a future version. Using `--per_device_train_batch_size` is preferred.
05/31/2020 00:07:54 - WARNING - transformers.training_args -   Using deprecated `--per_gpu_train_batch_size` argument which will be removed in a future version. Using `--per_device_train_batch_size` is preferred.
05/31/2020 00:07:54 - INFO - transformers.trainer_tf -   Created an/a adam optimizer
05/31/2020 00:07:54 - INFO - transformers.trainer_tf -   ***** Running training *****
05/31/2020 00:07:54 - INFO - transformers.trainer_tf -     Num examples = 24000
05/31/2020 00:07:54 - INFO - transformers.trainer_tf -     Num Epochs = 3
05/31/2020 00:07:54 - INFO - transformers.trainer_tf -     Total optimization steps = 750
WARNING:tensorflow:From /usr/local/lib/python3.6/dist-packages/transformers/trainer_tf.py:360: StrategyBase.experimental_run_v2 (from tensorflow.python.distribute.distribute_lib) is deprecated and will be removed in a future version.
Instructions for updating:
renamed to `run`
05/31/2020 00:07:54 - WARNING - tensorflow -   From /usr/local/lib/python3.6/dist-packages/transformers/trainer_tf.py:360: StrategyBase.experimental_run_v2 (from tensorflow.python.distribute.distribute_lib) is deprecated and will be removed in a future version.
Instructions for updating:
renamed to `run`
WARNING:tensorflow:From /usr/local/lib/python3.6/dist-packages/tensorflow/python/ops/resource_variable_ops.py:1817: calling BaseResourceVariable.__init__ (from tensorflow.python.ops.resource_variable_ops) with constraint is deprecated and will be removed in a future version.
Instructions for updating:
If using Keras pass *_constraint arguments to layers.
05/31/2020 00:08:02 - WARNING - tensorflow -   From /usr/local/lib/python3.6/dist-packages/tensorflow/python/ops/resource_variable_ops.py:1817: calling BaseResourceVariable.__init__ (from tensorflow.python.ops.resource_variable_ops) with constraint is deprecated and will be removed in a future version.
Instructions for updating:
If using Keras pass *_constraint arguments to layers.
/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/tensorflow/python/framework/indexed_slices.py:434: UserWarning: Converting sparse IndexedSlices to a dense Tensor of unknown shape. This may consume a large amount of memory.
  "Converting sparse IndexedSlices to a dense Tensor of unknown shape. "
2020-05-31 00:08:52.364556: W tensorflow/core/framework/op_kernel.cc:1753] OP_REQUIRES failed at sparse_xent_op.cc:90 : Invalid argument: Received a label value of -1 which is outside the valid range of [0, 25).  Label values: -1 24 -1 -1 -1 -1 24 24 -1 -1 -1 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 24 2 -1 -1 -1 24 0 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 24 -1 -1 -1 -1 24 24 -1 -1 24 -1 -1 -1 24 -1 -1 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 24 -1 -1 -1 -1 -1 24 -1 24 -1 24 -1 24 -1 -1 24 -1 24 24 6 24 -1 24 -1 24 -1 24 -1 -1 -1 24 -1 -1 -1 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 0 24 3 -1 24 24 24 24 -1 -1 1 24 -1 -1 -1 -1 9 21 -1 -1 24 0 -1 -1 -1 24 24 24 24 -1 -1 24 24 -1 -1 24 24 -1 -1 -1 3 15 15 24 -1 -1 -1 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 24 24 24 24 -1 -1 24 -1 24 24 -1 -1 24 -1 24 -1 -1 -1 -1 24 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 6 24 24 24 6 18 18 24 24 6 24 -1 -1 24 24 24 -1 -1 -1 24 24 9 21 -1 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 -1 -1 -1 24 -1 24 -1 24 -1 24 -1 24 -1 24 24 24 -1 -1 24 24 24 -1 24 -1 24 -1 24 -1 -1 -1 -1 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 24 -1 24 -1 -1 -1 24 -1 -1 -1 24 -1 9 24 9 21 24 24 -1 24 24 0 -1 -1 24 -1 -1 24 24 -1 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 -1 24 -1 24 -1 24 24 -1 -1 -1 24 -1 24 24 -1 24 -1 24 -1 24 -1 24 -1 -1 -1 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 24 -1 24 -1 -1 24 -1 0 -1 24 2 -1 -1 -1 24 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 24 24 -1 -1 -1 -1 -1 24 24 3 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 -1 24 -1 -1 24 24 -1 -1 24 24 24 -1 -1 -1 24 24 -1 -1 -1 -1 -1 24 -1 -1 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 -1 -1 24 24 24 -1 24 -1 24 -1 24 -1 24 24 -1 24 -1 -1 24 -1 24 24 24 24 -1 -1 -1 -1 24 24 -1 -1 -1 -1 24 -1 -1 24 -1 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 24 24 -1 24 24 -1 24 24 24 -1 -1 24 -1 -1 -1 24 -1 24 -1 -1 24 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 -1 24 -1 -1 -1 24 -1 -1 24 -1 24 -1 -1 24 24 -1 -1 24 -1 -1 -1 -1 24 -1 -1 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 -1 24 24 -1 24 -1 24 24 24 24 -1 9 24 -1 -1 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 24 24 -1 24 -1 24 24 -1 24 -1 24 -1 24 -1 24 24 24 24 -1 -1 24 -1 24 -1 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 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Traceback (most recent call last):
  File "run_tf_ner.py", line 281, in <module>
    main()
  File "run_tf_ner.py", line 213, in main
    trainer.train()
  File "/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/transformers/trainer_tf.py", line 277, in train
    for training_loss in self._training_steps():
  File "/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/transformers/trainer_tf.py", line 321, in _training_steps
    for i, loss in enumerate(self._accumulate_next_gradients()):
  File "/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/transformers/trainer_tf.py", line 354, in _accumulate_next_gradients
    yield _accumulate_next()
  File "/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/tensorflow/python/eager/def_function.py", line 580, in __call__
    result = self._call(*args, **kwds)
  File "/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/tensorflow/python/eager/def_function.py", line 708, in _call
    return function_lib.defun(fn_with_cond)(*canon_args, **canon_kwds)
  File "/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/tensorflow/python/eager/function.py", line 2420, in __call__
    return graph_function._filtered_call(args, kwargs)  # pylint: disable=protected-access
  File "/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/tensorflow/python/eager/function.py", line 1665, in _filtered_call
    self.captured_inputs)
  File "/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/tensorflow/python/eager/function.py", line 1746, in _call_flat
    ctx, args, cancellation_manager=cancellation_manager))
  File "/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/tensorflow/python/eager/function.py", line 598, in call
    ctx=ctx)
  File "/usr/local/lib/python3.6/dist-packages/tensorflow/python/eager/execute.py", line 60, in quick_execute
    inputs, attrs, num_outputs)
tensorflow.python.framework.errors_impl.InvalidArgumentError:  Received a label value of -1 which is outside the valid range of [0, 25).  Label values: -1 24 -1 -1 -1 -1 24 24 -1 -1 -1 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 24 2 -1 -1 -1 24 0 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 24 -1 -1 -1 -1 24 24 -1 -1 24 -1 -1 -1 24 -1 -1 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 24 24 -1 -1 -1 -1 -1 24 -1 24 -1 24 -1 24 -1 -1 24 -1 24 24 6 24 -1 24 -1 24 -1 24 -1 -1 -1 24 -1 -1 -1 24 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 -1 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	 [[{{node cond/else/_1/StatefulPartitionedCall/sparse_categorical_crossentropy/SparseSoftmaxCrossEntropyWithLogits/SparseSoftmaxCrossEntropyWithLogits}}]] [Op:__inference_fn_with_cond_30948]

Function call stack:
fn_with_cond
2

Oh the example was missing this parameter in python3 run_tf_ner.py to work. Would be good to update the doc:

--logging_dir ./my-model/
3

I believe the difference is in https://github.com/huggingface/transformers/blob/master/examples/token-classification/utils_ner.py starting at line 139 where it has different logic for tensorflow but not sure what the specific cause it.

4

Narrowing down to utils_ner.py line 149:

pad_token_label_id: int = -1

Pytorch version uses -100. This seems to be the only labeling difference that I can tell. I tried to change this line to -100 as well. But tensorflow code doesn’t seem to accept -1 or -100.

5

You might get a better and faster answer on StackOverflow for TensorFlow-specific questions, as we are mostly familiar with PyTorch. :wink:

6

ok thanks :slight_smile: